Which preservation buffer keeps mushroom DNA happiest? Comparing RNAlater and DESS across 320 field and market samples, we found the two perform essentially the same — unless your extraction protocol includes freeze-drying, where DESS’s salt crystals will make you cry. Published in Heliyon, led by Yu-Ja Li with 歐玠皜 and Che Chih Chen.
實驗室發了一篇小文章,幫大家測一下怎麼保存香菇(?)比較好
我們去全聯(沒有業配)買了市售香菇和鮑魚菇保存在RNAlater和DESS兩種DNA保存液中,放在常溫與冷藏後,分別看1, 10, 20, 及30天後DNA保存的情形。另外一組實驗,感謝Che Chih Chen幫忙,採了160個菇體(總共320個樣本,學生抽到手酸),同樣保存於RNAlater和DESS兩種DNA保存液中來看它們的DNA保存狀況。
先說結論:RNAlater和DESS兩種保存溶液對於菇類的DNA的品質與濃度基本沒有差異。
唯一一個不同點在於如果各位實驗室的抽DNA的protocol中,有包含低溫乾燥樣本(對於菇類來說,我們覺得可以有效增加核酸抽取效率)這個步驟的話,那RNAlater會是你的選擇。DESS裡面有大量的鹽(NaCl)析出結晶,會讓你的DNA抽取品質和後續PCR做到哭出來。如果不需要乾燥樣本的話,那兩者沒有差異,DESS又省又好配 (歐玠皜強推)。
當然這些溶液的保存對象,我猜不只真菌樣本,其他像是動物、植物、甚至組織內的共生菌應該都是通用的。不過還沒測,歡迎肉身測試回報XD
全文連結在這邊,有興趣可以參考: