Our upgraded island-wide soil survey of the opportunistic pathogens Scedosporium and Lomentospora is out in Medical Mycology. With 11 soil chemistry factors and the Human Footprint Index (found by 吳昕懋) in the model, only human impact predicted where these fungi occur — nitrogen, pH and friends showed no correlation.
這禮拜很幸運，第二篇被接受的文章。是關於Scedosporium和Lomentospora這些真菌的環境調查，這類一直都是我們有在關注的伺機性病原菌。
當初會跳下來做這個議題，原因說來也有趣，大概可以回溯到我碩班/助理期間在研究小蠹蟲真菌相時，意外地在樹上找到和Scedosporium很近的一類菌，在做它們親緣探討的時候，發現很多人會將Scedosporium當作根群，從而查了一下這類菌，發現好像是很重要的人體病原菌。從誤打誤撞地開始分離這些菌的時候，發現它們在環境裡面還真多。從盆栽、公園、各大景點的土，怎麼分都有，好有成就感(?)。但是搭配著感染的case report，從此做養菌都開始戴手套，呵呵。也因為開始研究這群菌，認識了一些醫學真菌的大前輩們，到現在誤入醫學大學，更有理由可以持續誤入歧途繼續研究這類菌。
2023年我們把之前的環境調查結果發表在Medical Mycology上面，但當時受限於技術和經費，沒有辦法將這類菌和環境因子（如有機質、氮、磷、鉀等）做連結，這點讓我一直覺得很可惜。到現在自己當起實驗室資深會計員之後，加上遇到有心的學生，以及屏科大吳羽婷老師的強力外援之後，終於可以把這塊補齊。除了環境因子外，在幾乎要完成數據分析的時候，吳昕懋還找到了一個很棒的指標–人為影響指數(huamn impact index)–很有效的幫這篇研究補齊了最後、也是最重要的一個探討因子。最終呢，這個人為影響指數也是我們數據中唯一和Scedosporium和Lomentospora於環境中分佈的相關因子，其他的環境因子，包括先前認為有關的氮、pH等，很意外的，竟然都沒有相關性。
不過negative data也是data，幸好實驗設計還算嚴謹，reviewers也沒刻意刁難，讓我們在兩年內再把承載著fungal burden的台灣地圖刊登在Medical Mycology上。